W roku 1948 powołano w Politechnice Warszawskiej Wydział Ruchu Kolejowego przemianowany w rok później na Wydział Komunikacji. Na Wydziale tym kształcono inżynierów na specjalności eksploatacja kolei i zabezpieczenie ruchu pociągów.

Prekursorami działalności tego Wydziału byli wybitni specjaliści nie tylko z dziedzin związanych z prowadzonymi specjalizacjami, ale także z dziedziny telekomunikacji kolejowej, konstrukcji i eksploatacji pojazdów szynowych oraz trakcji elektrycznej. Należeli do nich:

• Prof. dr W.Wyrzykowski,
• Prof. T.Wazynski,
• Prof. H.Smigielski,
• Prof.dr H.Sobolewski,
• Doc. S.Plewako,
• Prof. S.Skawinski,
• Prof. R.Szajer.

W roku 1970 w Politechnice Warszawskiej przeprowadzono reorganizacje i na Wydziale Maszyn Roboczych i Pojazdów powołano Instytut Transportu, który od roku 1972 został samodzielna jednostka organizacyjna na prawach Wydziału. Instytut kierowany przez prof. dr hab. inż. Mirosławę Dabrowę-Bajon oraz prof. dr inż. Wiesława Bajona nie tylko kontynuował tradycje dydaktyczne i naukowe dawnego Wydziału Komunikacji, ale zgodnie z potrzebami i wymogami postępu rozszerzył swoje zadania. Dlatego w skład Instytutu weszła grupa specjalistów transportu samochodowego kierowana wówczas przez prof. Wiktora Sudrę. Swoją działalność rozpoczął także zespół informatyków.

Instytut składający się z pięciu zakładów naukowo - dydaktycznych kształcił magistrów inżynierów transportu w trzech podstawowych specjalnościach:

• organizacja i technika transportu kolejowego,
• sterowanie ruchem w transporcie,
• eksploatacja i utrzymanie pojazdów.

W całym okresie działalności Wydziału Komunikacji i Instytutu Transportu wypracowano i modernizowano model kształcenia inżyniera, i magistra inżyniera transportu. Wychowano liczną, młodą kadrę naukowa legitymującą się znacznymi osiągnięciami naukowymi. Wyrazem tego są uzyskane i uzyskiwane obecnie stopnie i tytuły naukowe oraz liczne prace naukowo - badawcze wykonywane dla potrzeb gospodarki.

Międzynarodową rangę działalności Instytutu nadawały i nadają:

• współpraca z licznymi ośrodkami naukowymi poza granicami kraju (Aachen, Berlin, Drezno, Żylina, Leningrad),
• udział i organizowanie międzynarodowych konferencji dotyczących zagadnień transportowych,
• staże pracowników zagranicznych, staże zagraniczne własnych pracowników i staże doktorskie.

W 1979 roku Instytut uzyskał uprawnienia do nadawania stopnia naukowego doktora nauk technicznych w dyscyplinie Transport.

W czerwcu 1992 roku, decyzją Centralnej Komisji ds Tytułu Naukowego i Stopni Naukowych, Instytut uzyskał uprawnienia do nadawania stopnia naukowego doktora habilitowanego nauk technicznych w dyscyplinie Transport.

W grudniu 1992 roku uchwałą Senatu Politechniki Warszawskiej, dotychczasowy Instytut przekształcony został w pełnoprawny Wydział Transportu.

Pierwszym dziekanem Wydziału Transportu PW był dr hab inż. Andrzej Jabłoński (lata 1992-1996).
W latach 1996-2002 funkcję tę sprawował prof. dr hab. inż. Jerzy Leszczyński

Od października 2002 roku funkcję Dziekana Wydziału Transportu PW pełni
prof. dr hab. inż. Andrzej Chudzikiewicz.

Wydział składa się obecnie z jedenastu Zakładów naukowo - dydaktycznych. W strukturze Wydziału ponadto wyodrębniono Ośrodek Informatyki.